Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK4Q16099 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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