Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VAMP3Q15836 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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