Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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