Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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NECTIN1Q15223 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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