Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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MLC1Q15049 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MLC1Q15049 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms