Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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CHD4Q14839 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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CHD4Q14839 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CHD4Q14839 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CHD4Q14839 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CHD4Q14839 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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