Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HNF4GQ14541 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HNF4GQ14541 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms