Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms