Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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