Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK13Q14004 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms