Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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