Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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