Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
TCOF1Q13428 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCOF1Q13428 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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