Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRSQ13332 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PTPRSQ13332 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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