Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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