Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms