Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRDM2Q13029 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
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