Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4Q12950 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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