Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SYCNQ0VAF6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms