Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GOLGA3Q08378 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA3Q08378 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms