Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNDQ07001 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNDQ07001 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNDQ07001 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNDQ07001 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms