Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC9Q06265 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms