Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms