Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms