Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A2Q05940 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms