Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALD1Q05682 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms