Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms