Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms