Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1BQ00975 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms