Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSF1Q00613 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms