Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms