Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms