Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HBBP68871 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HBBP68871 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HBBP68871 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms