Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms