Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPCS3P61009 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPCS3P61009 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPCS3P61009 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SPCS3P61009 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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SPCS3P61009 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPCS3P61009 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPCS3P61009 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPCS3P61009 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPCS3P61009 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPCS3P61009 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SPCS3P61009 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPCS3P61009 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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