Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVFC1P60507 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms