Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR4P51571 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms