Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB28P51157 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB28P51157 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms