Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1EP49674 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK1EP49674 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms