Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NESP48681 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NESP48681 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NESP48681 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NESP48681 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NESP48681 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NESP48681 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms