Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP8P40818 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP8P40818 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP8P40818 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP8P40818 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP8P40818 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms