Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPGP40121 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPGP40121 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms