Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPARGP37231 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPARGP37231 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPARGP37231 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms