Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBRP36941 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBRP36941 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms