Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKLRP30613 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKLRP30613 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms