Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PPIFP30405 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms