Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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