Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK6P29122 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms