Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJB2P29033 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms