Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABRB3P28472 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms